Die Sauerstoffatome von Ozon binden und oxidieren leicht zu infektiösen Mikroben wie Viren, Bakterien, Pilzen, Prionen usw. Diese Bindung verursacht das Aufbrechen der Zellwände und Virushüllen des Organismus, was zu einer schnellen Zerstörung der Mikroben führt.
Ozon, ein starkes Oxidationsmittel, wirkt gegen verschiedene Arten von Mikroorganismen auf Obst und Gemüse. Bei der Lösung der Probleme der Lebensmittelindustrie wie Mykotoxin- und Pestizidrückstände durch Ozonanwendung wurden vielversprechende Ergebnisse erzielt. Die spontane Zersetzung ohne Bildung gefährlicher Rückstände im Behandlungsmedium macht Ozon in Lebensmittelanwendungen sicher. Bei unsachgemäßer Anwendung kann Ozon einige schädliche Auswirkungen auf Produkte haben, wie z. B. Verluste in der sensorischen Qualität. Die Behandlungsbedingungen sollten für alle Arten von Produkten für eine wirksame und sichere Verwendung von Ozon speziell festgelegt werden.